盡管有些男子的性器官疾病不是性傳播疾病，但也不宜進行性生活，以免加重病情或影響女方。男性性器官疾病包括：
①性器官先天畸形，如外生殖器異常、重度尿道下裂等，患者尿道口並非開在陰莖頭端部，而是開在陰莖體內或會陰部等，會使陰莖勃起時出現障礙，尿道下裂還會影響射精。
②性器官急性炎症，如睪丸炎、附睪炎、精索炎、攝護腺發炎、精囊炎等，特別是在急性發作期，應禁止性生活，因為性交時性器官高度充血與水腫，性刺激會加重病情並增加不適。
③性器官的特殊感染，如結核、性病、滴蟲病等，患病期間過性生活在加重病情的同時，也會將病傳染給配偶。
④某些性器官腫瘤，如陰莖癌、睪丸腫瘤、攝護腺癌等必須停止性生活，否則性交可加速性器官的血液循環，提高癌細胞轉移的風險，而且對女性的健康也不利。
⑤性器官的皮膚病，如陰莖部的疣、陰囊部的濕疹等，會因房事不潔而增加繼發細菌感染的機會，所以要在病情基本控制後才能行房事。此外，泌尿系統感染，尤其在罹患尿道炎、膀胱炎時，也要停止性生活。
